剑桥大学开发新分析工具优化病原体变种监测 | 联合早报

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2025-01-04

英国剑桥大学领衔的研究团队近日宣布，他们开发出一种名为“phylowave”的分析工具，能追踪病原体家谱中种群组成的动态变化，自动识别具高危险性新变种，从而提高变种鉴定效率和准确性，帮助公共卫生机构及时作出回应。

新华社报道，这个分析工具能根据病原体不同变种的亲缘关系，绘制系统发生树（Phylogenetic Tree），记录不同基因型之间的进化关系。研究团队在《自然》杂志上发表的论文中指出，phylowave能通过分析受感染人群的病原体样本，量化各变种的适应环境能力，并自动识别适应性和传播力较强的新变种。

这个工具已在对甲型H3N2流感病毒、百日咳杆菌（Bordetella pertussis）和结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis）等病原体的分析中得到验证。研究发现，新的分析工具不仅能识别已知的主要变种，还能发现一些此前未知的、适应性较强的变种。

细菌和病毒的进化速度极快，可随时出现传播力更强、更擅长逃避免疫系统攻击或能对抗疫苗和药物作用的新变种。及时识别这些变种及其适应性优势，是应对传染病挑战的关键。

传统基因分析方法在新变种鉴定效率和精度上存在不足，且确认新变种往往依赖专家团队讨论，带有一定主观性。与之相比，phylowave在效率和客观性上更具优势，对病原体样本的要求也更低，即便样本数量较少或抽样存在偏差，依然能有效分析。

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