从发现到发表仅2年！他感慨：中国的科研“如此高效”_风闻

来源：微信公众号“科学网”

文 | 《中国科学报》记者 王兆昱 见习记者 江庆龄

“一蓑烟雨任平生。”在读到苏轼的词时，生物遗传学家丹尼尔·法鲁什（Daniel Falush）找到了知音，这句诗词亦是他人生的真实写照。

21年前，丹尼尔关于幽门螺杆菌基因组学的研究登上Science。多年来，他一直深耕此领域。

“中国的胃癌发病率较高，能否从细菌基因组学的角度找到原因？”2019年，丹尼尔从伦敦起飞，跨越重洋来到上海，成为中国科学院上海免疫与感染研究所的研究员。4年间，他组建起一支充满活力的国际化团队。

丹尼尔常感叹，在中国做研究“很高效”。10月16日，Nature在线发表了丹尼尔团队的最新成果。他们发现了一种与常见类型不同的幽门螺杆菌“生态种”，它常伴随更严重的胃病。

这一研究，从发现到发表，仅用两年时间。

丹尼尔（左一）与他的团队。

发现独特“生态种”

对大多数病原体来说，人类胃部是个“禁区”，强酸会将它们一一消灭。然而，幽门螺杆菌不仅能在胃酸中生存，还能潜入胃黏膜并迅速繁殖，甚至使胃部的细胞“叛变”，引发持续性炎症，最终成为胃癌的隐秘推手。

更可怕的是，幽门螺杆菌的感染往往在童年时发生。由于儿童的免疫系统不成熟，细菌更容易“扎根”，导致终生感染。

“自人类诞生以来，幽门螺杆菌就与我们同在，我们想找出其历史的更多细节。”丹尼尔告诉《中国科学报》。

带着这样的“执念”，丹尼尔团队联合瑞典、日本的科学家，着力收集世界各地的幽门螺杆菌样本，甚至前往人迹罕至的偏远地区采样。从寒冷荒芜的西伯利亚，到“与世隔绝”的美国原住民社区，都留下了他们的足迹。

“功夫不负有心人”，他们汇集了一个相当广泛的全球样本，共包含近7000个幽门螺杆菌基因组。

在此基础上，研究人员发现了一组非常有趣的菌株。此菌株与常见类型不同，存在于北美、西伯利亚、智利的一些土著群体中。他们将其命名为“hardy”，寓意为“耐寒的”。

“这是一种不寻常的‘生态种’。”丹尼尔解释道，“生态种指同一物种内，因适应不同生态环境，而在基因上表现出微小差异的种群。”

Nature官网论文截图。

研究人员推测，幽门螺杆菌在人类早期、走出非洲之前就分裂为两种“生态种”，并随着人类的迁徙在全球传播。

随着进一步研究，丹尼尔团队还在老虎、猎豹等大型猫科动物（食肉动物）的胃部发现了hardy菌株的“身影”。

他们大胆提出假设：hardy菌株可能与爱吃肉的饮食习惯相关。证据是hardy菌株发展出了基因的“第二版本”，编码了额外的依赖铁的尿素酶，以帮助它们适应食肉动物更酸的胃。但该假设尚未经过验证。

此外，带有hardy菌株的人通常患有严重的胃病，胃癌发病率很高。“但尚未证实hardy类型有更强的攻击性。我们希望在不远的将来找到答案，并助力设计更好的治疗方法。”丹尼尔说。

中国科研：“很高效”！

丹尼尔坦言，早先也有学者注意到hardy菌株的存在，但丹尼尔团队不仅发现了这一“生态种”，还详细阐明了其背后的进化历史，“我们提出了完整的进化假说，并用大量的证据加以支持” 。

“多年来，我们一直收集并分析幽门螺杆菌的数据，建立起很好的科研声誉。”回忆起过去，丹尼尔的语气中透着一丝自豪。

2022年10月，团队发现了hardy菌株，大家无不为此感到振奋。经过数月的研究，他们撰写了论文，并将其公布在预印本平台bioRXiv上。如今，论文已在Nature上顺利发表。

谈及在中国的科研体验，丹尼尔总结为3个字——“很高效”。来到中国以后，在中国科学院的支持下，他迅速组建起一支强大的团队。

事实上，在来中国之前，丹尼尔就已经与中国的科研人员有合作，这为他日后组建团队打下了良好的基础。如今，他的研究团队呈现出两个显著的特点：“金字塔”结构和国际化。

“我们的团队像一座金字塔。”丹尼尔解释道，除了他本人外，团队还有两个“中坚力量”——青年研究员萨拉·斯文森（Sarah Svensson）和杨超。他们经验丰富，能够独立带领项目，这大大提高了整体效率。其他成员也可以随时和他们讨论。

（从左至右）丹尼尔、萨拉、杨超。

国际化同样是团队的一大优势。丹尼尔认为，国际化不仅提升了每个人的英语水平，还有助于大家学习不同的科研风格和思维方式。

“找到内心的自由”****

丹尼尔对科研的态度直率而笃定。虽然他已经在Science和Nature这样的顶刊上发表了6篇论文，但他不认为顶刊能代表顶尖的研究。他相信，好的科研不一定要在知名期刊上发表，而是要有实质性的贡献。对生物学领域来说，特别关键的是数据分析方法上的创新。

丹尼尔告诉《中国科学报》，有许多外国教授痴迷于“卷”论文数量，但他更在意科研的质量。“不会执着于许多项目，或多多益善地发表论文。我更看重一个好点子、一篇好论文的价值。”丹尼尔微笑着说。

丹尼尔。

除了科研，丹尼尔还很快融入了上海的生活。他成为广场舞圈中的“灵魂舞者”，跳起舞来恣意潇洒，不拘一格。他会拍下自己与中国阿姨们共舞的动图，做成表情包，每当所里有其他研究人员发了论文，就将表情包发在群里，以表庆祝。

‍丹尼尔跳舞动图。

“Find inner freedom（找到内心的自由）”，这是丹尼尔的座右铭，也贯穿了他的人生选择和科研追求。

“我在英国遇到了各种职业上的挫折，但在中国，我找到了新的机会。”丹尼尔说。每年夏天他会回到英国陪伴家人，但大部分时间还是沉浸在上海的工作和生活中。

在快节奏的生活中，丹尼尔努力保持内心的自由。工作累了，他会暂时放下，“给自己放个假”，睡个懒觉。但即便是在休息时，他的思绪也从未停止。在走路甚至跳舞时，他常常思考不同的科研问题。

丹尼尔对中国充满了热情和好奇，是个“中国通”。他去过中国的6个省份远足，攀登过一座5000米的高峰。“我喜欢中国的乡村，尤其是西部，那里的人们以更传统的方式生活，却更加轻松和奔放。‍”丹尼尔说。

对于学生，丹尼尔并不强求他们为科研投入过多的时间，他希望学生的动力来自内心。“他们需要做足够的工作才能毕业，但更重要的是，要从中找到自己的兴趣点。”在丹尼尔看来，科研的迷人之处在于长期的、逐步深入的探索。

“当你投入得足够深，事情就会开始变得有趣。”他说，幽门螺杆菌的研究正是如此——每一个细节、每一次发现都带来新的惊喜。

团队就像大家庭。

在中国的这些年，他发现中国学生做事高效认真，但不太擅长找到自己的科研方向；而西方学生常常有自己的想法，但可能并不是好的想法。丹尼尔期待，下一代年轻人能够平衡好中西方学生的优缺点。

丹尼尔给学生的建议是：发展自己的兴趣，尤其是参加更多体育锻炼。“我认识很多优秀的科学家，都有健康的体魄。”有时，丹尼尔会拉着自己的学生去跳舞。

对于中国社会一些不好的现象，丹尼尔也大胆开麦：“比较文化在中国相当普遍，我不喜欢它。它经常让人感到困惑——真正的目标是什么？”

在采访的最后，丹尼尔分享了一则轶事：亚历山大·格罗滕迪克被誉为“20世纪最伟大的数学家”，他的童年在躲避纳粹迫害中度过。他没有接受过正统的学校教育，而是生活在森林里，与大自然和动物为伴。

丹尼尔对此深有感触。虽然他的经历与格罗滕迪克不同，但他也在跨越重洋的科研旅途中找到了自己的“内心自由”。正是在不断打破外在限制的过程中，真正的创新和突破得以产生。

论文链接：

https://doi.org/10.1038/s41586-024-07991-z