诺奖得主涉嫌造假，被撤回了13篇PNAS等高水平文章_风闻
熊猫儿-1小时前
2019年，诺贝尔生理与医学奖联合授予William G. Kaelin Jr、Sir Peter J. Ratcliffe和Gregg L. Semenza，以表彰他们“对细胞感知和适应氧气供应的发现”。
近期，Gregg L. Semenza被质疑多篇论文涉嫌学术不端，Pubpeer已经挂了他52篇论文。
这些被质疑涉嫌学术不端的论文，时间跨度从2001年到2021年，论文发表的期刊包括Science Signaling、Cell Reports、Journal of Biological Chemistry、PNAS、Cell Metabolism、Cancer Research、JCI 等期刊。
这些被质疑的论文所涉及的学术不端，主要是一图多用，图片PS等。目前仅有少数几篇被质疑论文得到作者回应，作者回应称“论文中无意的错误并不影响实验结论”。
截至2024年9月5日，Gregg L. Semenza至少纠正了6篇文章，撤回了13篇文章：包括Gregg L. Semenza撤回了1篇Molecular Cancer Research，2篇Cancer Research（2024年9月4日被撤回2篇），5篇PNAS ，1篇Oncogene****，3篇Journal of Biological Chemistry****，1篇Biochemical Journal****。********
1.Collagen Prolyl Hydroxylases Are Essential for Breast Cancer Metastasis
应作者的要求，这篇文章已被撤回。在几位作者的主要合作伙伴约翰霍普金斯大学的机构审查之后，确定在图1B中，HIF-1α Western blot的5和7泳道被复制，P4HA1 Western blot的5和7泳道被复制。此外，正如之前在编者注(2)中发表的那样，代表HIF-1α、HIF-2α和肌动蛋白的Western blot条带也被作者在2012年Oncogene发表的图1A中使用(3)。作者向科学界道歉，并对因发表和随后撤回这篇文章而造成的任何不便或挑战深表歉意。
这份撤稿通知的副本被发送到九位作者中八位最后已知的电子邮件地址。三位作者(Daniele M. Gilkes、Denis Wirtz和Gregg L. Semenza)同意撤回论文；五位作者(Pallavi Chaturvedi、Saumendra Bajpai、Carmen C. Wong、Hong Wei和Maimon E. Hubbi)没有回应；剩下的一位作者(Stephen Pitcairn)去世了。
2.PHGDH Expression Is Required for Mitochondrial Redox Homeostasis, Breast Cancer Stem Cell Maintenance, and Lung Metastasis
应作者的要求，这篇文章已被撤回。经过几位作者的主要合作伙伴约翰霍普金斯大学的机构审查，确定在图7F中，代表M1-sh2和M2-sh2的图像具有连续特征，表明这些图像可能来自同一只小鼠。此外，某些原始数据被标记为来自M2-sh2和M3-sh2小鼠，但也具有连续的特征，这表明这些数据也可能来自同一只小鼠。作者对数据的完整性没有信心，他们向科学界道歉，并对因发表和随后撤回本文而造成的任何不便或挑战深表歉意。
这份撤稿通知的副本已发送到所有六名作者最后已知的电子邮件地址。两位作者(Daniele M. Gilkes和Gregg L. Semenza)同意撤回论文；其余四位作者(Debangshu Samanta, Youngrok Park, Shaida A. Andrabi和Laura M. Shelton)没有回应。
3.Procollagen Lysyl Hydroxylase 2 Is Essential for Hypoxia-Induced Breast Cancer Metastasis,Molecular Cancer Research
应作者的要求，这篇文章已被撤回。作者发现图3A中HIF-1α免疫印迹的4、5和6泳道是相同的图像。内部审查证实了作者的说法，编辑同意了作者的撤稿请求。作者向科学界道歉，并对因发表和随后撤回这篇文章而造成的任何不便或挑战深表歉意。
本撤回通知的副本已发送到所有作者最后已知的电子邮件地址。四位作者(Denis Wirtz、Carmen C. Wong、Daniele M. Gilkes和Gregg L. Semenza)同意撤稿;其余3名作者无法找到。
4.HIF-1-dependent expression of angiopoietin-like 4 and L1CAM mediates vascular metastasis of hypoxic breast cancer cells to the lungs,Oncogene
作者已经撤回了这篇文章，因为在这篇文章中已经注意到多个图像的不规则性，具体来说:
图1A，上面板(HIF-1a印迹)，5号泳道和7号泳道似乎是重复的。
图6B，下面板(b-肌动蛋白印迹)，前六个通道似乎与图6G，下面板(b-肌动蛋白印迹)相同。
图3G, D10生理盐水组第三只小鼠的图像与D21地高辛组第三只小鼠的图像相同。
5.Mitochondrial autophagy is an HIF-1-dependent adaptive metabolic response to hypoxia,Journal of Biological Chemistry
这篇文章已被作者撤回，除了F. Gonzalez不同意这一撤回通知，以及无法联系到J. B. Wesley。撤回的作者和期刊得出结论，
Figure 3B corresponding to the 20% lane in the ‘KO-EV’ panel.
Figure 4A presented background issues on the 20% lane of the ‘WT-EV’ panel.
In figure 8A, in the ‘Anti-Bcl2’ top panel a band in the ‘IgG’ panel, ‘WT, 20%’ lane was potentially artificially removed.
There were signs of duplication in the FACS plots in figure 9F. In supplemental figure S4, there were signs of potential splicing between lanes 2 and 3.
Supplemental figure S5 presented signs of background manipulation on lane 1 on ‘Anti-Bcl2’ top panel. In supplemental figure S6 ‘WCL’ panel on the left, the ‘Anti-Bcl2’ top panel presented artificially deleted bands on lanes 1, 2, 5 and 6.
In addition, in the ‘IP’ immunoblot panel on the right, lane 1 in anti-Flag top panel, the band was artificially removed.
The ‘Anti-Bcl2’ panel at the bottom presented signs of inappropriate manipulation.
提供的原始数据并不能解决这些问题。
6.Hypoxia-inducible factor 1 (HIF-1) promotes extracellular matrix remodeling under hypoxic conditions by inducing P4HA1, P4HA2, and PLOD2 expression in fibroblasts,Journal of Biological Chemistry
除了S. Bajpai和P. Chaturvedi未能联系上外，这篇文章已被作者撤回。
作者和期刊得出结论，
Figure 1 presented background issues on ‘FN’ panel, lane 1.
Figure 2B, ‘FN’ panel corresponding to ‘Conditioned media’ (bottom panel in the middle), lanes 1 and 4 were reused.
the top right panel for ‘ECM’, lanes 3 and 4 were reused.
‘Conditioned media’ top middle panel, lanes 1 and 4 were reused. Figure 3B ‘HIF 1a’ top panel, lanes 5 and 7 were reused.
supplemental figure S1 A, in ‘HIF1’ panel lanes 2 and 4 were reused.
supplemental figure S1 B, ‘HIF2a’ panel, lanes 1 and 3 were reused.
‘Actin’ panel lanes 3 and 4 were spliced in.
supplemental figure S1 B, ‘P4HA1’ panel lane 1 was spliced in, and lanes 4 and 6 were reused.
supplemental figure S1 B, ‘P4HA2’ panel, lanes 4 and 5 were reused.
supplemental figure S1 C, ‘HIF1a’ panel, lanes 3 and 4 were reused.
supplemental figure S1 D, ‘P4HA1’ panel on top left, lanes 1 and 2 are spliced together with lanes 3 and 4.
supplemental figure S1 D, ‘P4HA2’ top middle panel, lane 1 was spliced in.
提供的原始数据并不能解决这些问题。
7.Acriflavine inhibits HIF-1 dimerization, tumor growth, and vascularization,PNAS
署名作者指出:“由于图2D底部面板的问题，我们撤回这篇文章。在这个印迹中，可以看到顶部的GST- hif -1β条带，中间有一个微弱的双重条带，底部有一个迁移在GST上方的强条带，这可能是GST- hif -1β的降解产物。在中间的双线图中，2、5、8泳道似乎是重复的图像；泳道3、6和9是重复的图像；泳道4和泳道7是重复的图像。还有人担心底部条带显示的数据可能被操纵。我们认为论文的总体结论仍然有效，但由于对数据的这些潜在担忧，我们正在撤回这项工作。给您带来的不便，我们深表歉意。”
8.Hypoxia-inducible factors are required for chemotherapy resistance of breast cancer stem cells,PNAS
对于“Hypoxia-inducible factors are required for chemotherapy resistance of breast cancer stem cells”文章，撤稿声明指出：“我们正在撤回这篇文章，因为我们担心一些已发布的数据，我们认为这是在构建数据过程中选择了错误图像的结果。识别出正确的图像，并且不需要新的实验来纠正上述问题。这些更新的数据可以在 bioRxiv 上发布的预印本文章中找到，“Enrichment of breast cancer stem cells following cytotoxic chemotherapy is mediated by hypoxia-inducible factors”（https://doi.org/10.1101/2022.06.27.497729）。**我们相信这篇论文的总体结论仍然有效，但由于对这些图片的潜在担忧，我们正在撤回这项工作。**我们对不便表示抱歉。”
9.Anthracycline chemotherapy inhibits HIF-1 transcriptional activity and tumor-induced mobilization of circulating angiogenic cells,PNAS;
对于“Anthracycline chemotherapy inhibits HIF-1 transcriptional activity and tumor-induced mobilization of circulating angiogenic cells”文章，撤稿声明指出：“由于对图 2 的担忧，我们将撤回这篇文章。我们相信这篇论文的总体结论仍然有效，但由于对图片的潜在担忧，我们正在撤回这项工作。现在已经进行了验证性实验，结果可以在 bioRxiv 上发布的预印本文章中找到，“Daily administration of low-dose daunorubicin or doxorubicin inhibits hypoxia-inducible factor 1 and tumor vascularization”（https://doi.org/10.1101 /2022.06.15.492526）。我们对不便表示抱歉。”
10.Hypoxia-inducible factors mediate coordinated RhoA-ROCK1 expression and signaling in breast cancer cells,PNAS;
对于“Hypoxia-inducible factors mediate coordinated RhoA-ROCK1 expression and signaling in breast cancer cells”文章，撤稿声明指出：“由于对已发表的几个数据的担忧，我们正在撤回这篇文章。我们相信这篇论文的总体结论仍然有效，但由于对这些图片的潜在担忧，我们正在撤回这项工作。我们对不便表示抱歉。”
11.Mutual antagonism between hypoxia-inducible factors 1α and 2α regulates oxygen sensing and cardio-respiratory homeostasis,PNAS;
对于“Mutual antagonism between hypoxia-inducible factors 1α and 2α regulates oxygen sensing and cardio-respiratory homeostasis”文章，撤稿声明指出：“由于对图 5 的担忧，我们正在撤回这篇文章。 我们相信这篇论文的总体结论仍然有效，但由于对这个图片的这些潜在担忧，我们正在撤回这项工作。现在已经进行了验证性实验，结果可以在 bioRxiv 上发布的预印本文章中找到，“Homeostatic responses to hypoxia by the carotid body and adrenal medulla are based on mutual antagonism between HIF-1α and HIF-2α”（https：/ /doi.org/10.1101/2022.07.11.499380)，我们对不便表示抱歉。”
12.Activation of hypoxia-inducible factor 1 in human T-cell leukaemia virus type 1-infected cell lines and primary adult T-cell leukaemia cells,Biochemical Journal;
琉球大学的一项调查显示，这篇论文中出现的图片也曾在其他论文中使用，但没有适当的归属或解释(这种模式在不同期刊的许多出版物中重复出现)，Biochemical Journal杂志的编辑委员会撤回了这篇论文。最后一位作者森直树(Naoki Mori)对本文数据的错误表述承担全部责任。
13.Endothelial expression of hypoxia-inducible factor 1 protects the murine heart and aorta from pressure overload by suppression of TGF-β signaling,PNAS ;
署名作者指出:“我们撤回这篇论文的原因是考虑到图4F和图4G中总ERK1/2和磷酸化ERK1/2的免疫印迹分析数据。第一个问题是，在图4F中，使用了两种不同的印迹来分析总ERK1/2和磷酸化ERK1/2，而在图4G中，似乎相同的印迹被剥离并重复使用来分析总ERK1/2和磷酸化ERK1/2。第二个问题是，在图4F中磷酸化ERK1/2的分析中似乎存在通道剪接，这在图中没有显示。由于数据的完整性受到质疑，并且我们无法找到10多年前的原始数据文件，我们要求撤回这篇论文。对于由此造成的不便，我们深表歉意。”
这批被爆涉嫌造假的论文，其中存在的主要问题是：
1. 诟病最多的套路：一图多用或图片PS。
“Much more similar than expected”最常出现的评论。另一些图片则被质疑使用了PS修图大法。
2. 还有少数文章被质疑存在伦理问题。
这里实验鼠的肿瘤被质疑长得过大。
其他被质疑的数十篇论文情况类似，不再一一介绍，感兴趣的读者可以打开文末链接查看。
部分被质疑论文列表
