Transcripta Bio(Rarebase)利用人工智能研发罕见疾病药物 - 彭博社
Ashlee Vance
在Transcripta Bio,自动化机器人用于高通量药物筛选。
摄影师:丹尼尔·拉尔森
照片插图:731;摄影师:Jutharat Pinyodoonyachet为彭博商业周刊;YouTube在过去六年里,凯莉·里奇经历了一段没有父母希望经历的旅程。她的女儿患有由一种罕见基因病引起的自闭症,里奇迫切希望帮助她应对这种基因异常的影响。这使得女孩无法说话,削弱了她像7岁同龄人一样移动和互动的能力。“我与全球的研究人员、科学家、学者、企业家、慈善家、投资者和父母进行了交谈,”里奇说。“我的意思是,任何愿意与我交谈的人。我真的希望能找到一个能引导我朝积极方向前进的人。”
彭博商业周刊连任的特朗普能做什么和不能做什么来影响美联储这种临床护肤方案是38年研究的成果塑造美国选举的摇摆州经济现实内特·西尔弗想教你如何成为更好的赌徒里奇大多数时候遇到的都是坏消息。她发现一些处于类似境况的家庭因虚假的希望而破产或分崩离析。几乎没有迹象表明某种疗法可能在未来为她的女儿提供帮助。但去年,加利福尼亚的一组科学家开发了一种新的药物筛选程序,发现了一种他们认为可能帮助里奇女儿的药丸。这个孩子在12月开始服用这种药丸,早期迹象表明它正在起作用。
“她在某些方面变得更加反应灵敏了,”Rich说。“她有一架她喜欢弹的电子钢琴,开始自己把它插到墙上。之前她对插电这件事没有任何意识。”
“让我感动的是,当她在没有任何提示的情况下重复说‘我爱你’时。她一直是无言的。能够把三个词组合在一起,而且这三个词组合在一起,真是让人心都融化了,”Rich说。
Rich提供:Carrie Rich根据美国国立卫生研究院的资料,全球约有4亿人患有 罕见疾病,这被定义为影响不到20万人口的任何疾病。目前已知有1万种这样的疾病,其中三分之二影响儿童,使得追求任何类似于正常生活的事情变得不可能。(约30%的罕见疾病儿童活不过10岁。)但是,尽管有数百万人需要治疗,处理每种疾病的人数相对较少,使制药公司的经济计算变得复杂。制药公司通常拒绝投资于罕见疾病的研究、开发和临床试验,因为他们认为无法赚到足够的钱来证明这些开支是合理的。
Transcripta Bio成立于四年前,决定将罕见疾病作为其主要业务。这家公司总部位于硅谷,开始逐一与家庭合作,寻找各种疾病的潜在遗传原因以及可能有帮助的药物。Transcripta的发现之一就是Rich的女儿正在服用的药物。
Transcripta表示其技术具有更广泛的意义。得益于DNA测序机器、药物筛选技术和机器学习软件的进步,它开发了一种系统,可以查看市场上已有的数千种药物,并预测它们是否可能缓解各种疾病。该公司,前身为Rarebase PBC,在制药界规模微小。它获得了约3000万美元的资金支持,包括一轮新的1000万美元投资,正在努力证明其技术并寻求新的疗法。
多年来,研究人员设法揭示了许多罕见疾病的根本原因。大约五分之二的疾病可以追溯到个别基因的异常,更多的则是由于少数非典型突变造成的。(Rich的女儿缺失了两个基因的一半遗传密码。)这些数据,其中大部分是免费提供的,成为Transcripta药物发现的基础。
该公司首先使用软件标记有前景的化合物,然后在实验室培养的人类细胞上进行测试。在实验室中,观察药物增强或抑制的基因,Transcripta试图确定这样做是否可能缓解一种罕见的遗传疾病。
这种技术本身并不新颖。制药公司通常专注于他们试图解决的疾病,并进行试验以检查他们的药物是否对与该疾病相关的基因有效。然而,他们通常不会超出这一关注领域,尽管药丸和注射通常会影响数十到数百个其他基因。
在过去几年中,进行测序操作和相关实验以寻找这些额外效果的成本大幅下降。大约200万美元的实验室成本,Transcripta可以对所有已知的罕见遗传疾病进行筛查。这个价格与传统制药公司直到最近仅仅为了开始研究针对单一疾病的单一药物所支付的费用相似。Transcripta表示,Rich为她女儿的治疗支付了公司的费用,但拒绝透露具体价格。
“现在资本效率更高了,”Transcripta的首席执行官兼首席科学官Chris Moxham说。“这不仅仅是一次针对一种疾病。我们将拥有一个包含数百个项目的组合。”(一些导致成本突破的基础研究技术在一篇2018年的论文中有所介绍。)
迄今为止,Transcripta的方法已经发现了五种有潜力治疗其他疾病的药物,公司正在与患者及其医生合作以测量其效果。美国政府通常对实验的容忍度更高,当一种药物之前被认为是安全的,并用于治疗几乎没有其他选择的严重疾病时。
Transcripta并不是唯一采取这种方法的组织。例如,Perlara PBC和Every Cure也有类似的目标和技术。今年早些时候,非营利组织Every Cure获得了来自美国高级研究项目局的4830万美元的三年合同,旨在“释放现有药物治疗更多疾病的全部潜力。”
Moxham对Transcripta的雄心不仅限于将现有药物重新用于其他疾病。他表示,公司将与制药公司合作,分析那些未能完全通过临床试验的化合物,以查看这些化合物是否可能对其他疾病提供之前未曾预见的治疗。他还打赌Transcripta的技术将帮助设计全新的药物。
“在我们收到初步筛选的数据之前,我们并不知道这个平台的可能性,”Jazz Venture Partners的投资者John Lee说,该公司向Transcripta投资。“我们在不同的事物上看到了如此多的成功。这让我们有信心可以追求比罕见疾病更大规模的适应症,以及影响数百万人的事物。”到目前为止,Transcripta专注于神经系统疾病,但它正在迅速扩展,开始关注皮肤、眼睛和心脏疾病。
对于Rich来说,接下来的几个月将对确定新治疗对她女儿的有效性至关重要。最近的血液测试确认该药物在孩子体内加速了某些过程,这些数据也补充了Rich在家中和她女儿在学校的老师所做的观察。“我们的希望和愿望可能看起来相当简单,”Rich说。“但我们希望我们的孩子能够表达自己的需求,为自己发声,讲述自己的故事。”
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