新冠病毒是对专家的考验，谁才是王者_风闻

全文转自拍帮助的后花园[后台点播] 今日果·昨日因（重制版）  https://mp.weixin.qq.com/s/H3eu5CfxugpsbCb2WhELjw

大家晚上好，

话说前几天后台有老铁让咱评价一下这篇奇文：

(点击图片可以跳转原文)

咱看了下，大致感觉就是：

有人在不懂装懂（或者更像是在懂装不懂），

假借着转发大佬Trevor Bedford老师推文的名义，恶意贩卖私货。

不过，按说这篇奇文阅读量，

还不到咱这边随便哪篇日更的一半……

本来不值得专门花一天日更的机会来批判，

否则还会给他们带过去不少额外的点击~

但是呢，

一来刚好咱这边也想继续八卦一下变异走向这个话题，所以干脆借这篇奇文来做个引子得了~

二来，虽然Bedford老师实属顶流大佬，咱们这行神一样的无敌存在，但上面提到的那组推文，却是他这两年少见的翻车之作~于是在下顿时就心态膨胀了……咱打算连Bedford老师都不放过，趁机把他批判一顿吧

不出意外的话，这个话题会搞成上下两集，这集主要贩卖咱对未来病毒变异方向的一些主观盲猜；下一集则针对性地搞一搞奇文共赏，请各位耐心品鉴。

❷ 上文提要

《今日果·昨日因》这个系列，之前已经写过两个版本。

第一版请见：《今日果·昨日因》，

太长不看版总结：

从2020年底直到现在，每一款拿到专属希腊字母称号的VOC和VUI，

以及其他每一款有威胁但没能拿到专属称号的屁民变异株（比如C.1.2或者B.1.630这类），它们全部都是在各自的直接祖先过气6个月到16个月之后，突然冒头的，毫无预兆；

这些VOC/VUI或者屁民强者，全都没有经过Bedford老师（以及Hanson的王老师）心心念念的**“抗原漂变”（antigenic drift），而是采用一种“偶发快速突变”（episodic accelerated mutation），或者又叫“跃迁演化”**（saltation）的模式，迅速突变出全身上下的阴间变异，然后一面世就大杀四方、一桶浆糊；

而那些不走“偶发快速突变”模式，反而老老实实搞抗原漂变的分支，哪怕手气绝佳，逐渐累积出10%甚至20%的相对增长优势（比如AY.4.2这种的），也难逃背景板的宿命，被层出不绝的阴间变异株拍死在沙滩上；

所有这些发生“偶发快速突变”的阴间变异株，它们的练功房都大概率是免疫缺陷病例（小概率是动物宿主）。只要上一波时种下了恶因，6个月到16个月之后，就必然会结出恶果；

只凭打疫苗，没法打断这种“今日果昨日因”模式的恶性循环。

第二版请见：《今日果，昨日因（掉书袋版）》，

太长不看版总结：

之所以新冠病毒的变异株迭代，不走流感病毒那种抗原漂变为主（抗原转移为辅）的常规模式，而是改走更少见也更飘忽不定的跃迁演化模式，原因之一在于基因瓶颈；

抗原漂变的变异模式必须依靠连续的跨宿主传播实现，而新冠病毒跨宿主传播的瓶颈很窄，于是抗原漂变的变异模式（相对于跃迁演化模式）更不容易累积出优势突变组合；

所以后果就是，那些呼哧呼哧通过抗原漂变逐渐累积优势变异的分支，每隔几个月到半年左右，就会被突然不知道从哪个嘎达里冒出来的阴间变异株迅速拍死在沙滩上，成为被人遗忘的背景板（比如AY.4.2那种的）……

❸ 独走的突变速率

下面正式开始今天的表演~

哦对了，受到Hanson那篇奇文的启发，

咱突然发现，写公众号搬运paper做论据太麻烦了，

直接转帖各位大佬的推文更省事儿！

那么今天咱也模仿一手吧，

paper啥的就不放了，一言不合咱就放推文，

请各位做好心理准备，here we go!

总之，新冠病毒变异株的反常趋势，其实大佬们早就看出苗头了。

疫情刚开始那阵，病毒学家们就估算出来，

新冠病毒的突变速率，大概只相当于流感的四分之一~

（顺便解释一嘴，这里的突变速率，指的是病毒内生的分子钟速率，各位可以粗略地理解为一种基线速率）

等到Alpha面世之后，

大佬们纷纷发现，

四分之一这个估值已然没法解释现象，

于是临时加码，把这个速率调快了1.5倍~

（也就是说仍然比流感慢两倍多）

——比如，Drosten老师的原话，流感还是领先2.5倍：

但这显然没法解释越来越多阴间变异株层出不穷的怪现象，

于是，按照Bedford老师的原话，

新冠病毒的突变速率可能需要搞一搞细分大法……

——请品鉴：

翻译成人话：

嗯对对对，单个位点的突变速率，新冠还是不如流感，但新冠刺突蛋白S1结构域的那些重要氨基酸变异可是要比流感HA1蛋白快一点哦~

那么，新冠病毒的突变速率，或者说至少是刺突蛋白S1部分的突变速率，为啥暴走了呢？

❹ 大佬们的暗示

其实新冠病毒突变速率异动，及其背后的原因，

对于病毒学顶流大佬们而言，压根儿不是啥秘密~

只不过出于某些政治正确方面的考虑，可能不是很方便直接说出口……

比如，巨咖Stuart Neil老师是这样暗示的~

——请品鉴：

翻译成人话：

RNA病毒持续感染通常发生于免疫缺陷（的宿主身上），这种持续感染本身也许并不会（对宿主）造成严重后果，但病毒在有缺陷的免疫应答选择压力下持续复制越久，就越容易养出免疫逃逸专精的变异株。

哦对了，提醒一点，Stuart老师发推的时间是2021年9月份。

再比如，另一位巨咖Ravi Gupta老师则是这样暗示的……

——请再品鉴：

继续翻译成人话：

……需要强调正是持续感染导致了变异株的出现，但奇怪的是，我每次跟别人提到这一茬，大伙儿都茫然地看着我……

顺便一提，Gupta老师这条推也是2021年9月份的事儿。

可是现在问题就来了。

免疫缺陷病例显然并不是只会感染新冠一种RNA病毒；

新冠病毒显然也不是唯一能够在免疫缺陷病例体内形成持续感染的病原体。

那么为啥其他病毒没法利用免疫缺陷病例制造出特别麻烦的变异狂潮呢？

新冠病毒到底有什么特殊之处？

哦对了，Bedford老师其实也发现了这个秘密，

但他可能算是大佬里面开窍比较晚的~

直到今年1月份他才半信半疑地接受这一事实……

并且还忍不住发出了一些毫无意义的灵魂拷问~

——请接着品鉴：

翻译成人话：

我相信新冠病毒的变异株有时候是由持续感染（的宿主）养出来的，但我就是想不通，为啥我搞流感研究搞了小20年，我就从来没观察到流感持续感染催生阴间变异株的情况呢？

或者说，我们已经知道流感持续感染足以形成单宿主体内的变异株多样化，但为啥从来没观察到流感变异株通过这一机制造成广泛传播呢？

为啥新冠病毒如此与众不同？

所以这里咱就直说了吧，

为啥Bedford老师如此聪明绝顶的学界大佬会翻车？

甚至明天还会被咱这样的无名小学渣批判一通？

上面那条推文就能深刻说明原因。

“因为新冠跟流感它们俩天生不一样啊，Bedford老师！”

当然了，Bedford老师的灵魂拷问并非空穴来风，

比如以Omicron的诞生地南非为例，

根据另一位大佬Kucharski老师的推文~

——请品鉴：

翻译成人话：

根据NICD的研究结果，流感（一季）可以感染南非40%的人口！其中高达17%属于重复感染！

hmm……40%的罹患率，17%的重复感染率，

这数字虽然略逊色于Delta，但至少也可以跟原始株甚至Beta打平。

再考虑到南非至少有一千万HIV感染者，

那么为啥新冠病毒在南非可以养出Omicron这样的大怪物（以及C.1.2、B.1.638、Beta等小怪物），

为啥流感就不行？

为啥新冠病毒如此与众不同？

❺嗜性之谜

其实，那个让Bedford老师困惑不已的灵魂拷问，

可能正好能够反映出，

到底谁才是干湿实验+生信+临床全面制霸的真大佬~

——请品鉴：

翻译成人话：

如果我们把新冠病毒当做其他导致普通感冒的hCoV一样对待的话，就没法预测我们正在目睹的那些阴间变异株。

导致这些阴间变异株出现的关键因素是长期感染（宿主）体内可供感染的种类广泛的细胞，而这正是新冠病毒与众不同的特征。

请各位主要Gupta老师发这条推的日期：2021年6月2日。

惊不惊喜意不意外？

那么，Gupta老师所谓的“感染种类广泛的细胞”（a wide range of cells that can be infected），

到底是怎么样一种与众不同的特征？

说到这里，咱还是不得不掉一下书袋……

（放心，只是abstract里的一句话而已）

——请品鉴：

剪断截说，这是近期以色列特拉维夫大学几位老师发表的一篇关于持续感染与病毒体内变异的预印本~

咱把勾重点的那部分翻译成人话：

我们在大多数患者体内都发现了病毒种群呈动态多样化的证据，这表明有缺陷的免疫系统能够在患者体内特定组织/器官选出不同的免疫逃逸型变异株。

重要的事情重复三遍：

有缺陷的免疫系统能够在患者体内特定组织/器官选出不同的免疫逃逸型变异株。

有缺陷的免疫系统能够在患者体内特定组织/器官选出不同的免疫逃逸型变异株。

有缺陷的免疫系统能够在患者体内特定组织/器官选出不同的免疫逃逸型变异株。

……

……

呵呵，各位~

现在你们知道新冠病毒为啥与众不同了吧？

现在你们知道为啥抗原漂变那一套不好使了吧？

现在你们知道为啥老是出现今日果昨日因这种恶性循环了吧？

现在你们知道为啥BA.1、BA.2、BA.3、BA.4以及BA.5可以前后脚肆虐南非了吧？

现在你们知道为啥王博士和被他引用的Bedford老师都翻车了吧？

现在你们知道为啥必须要清零解百焦了吧？

因为免疫缺陷病例养蛊，

从来就不是每个人养一只蛊，

而是体内每一个器官、每一坨组织、每一种细胞，都有可能供养各不相同的蛊。

这就是为啥同样面对一千万HIV感染者，同样拥有40%罹患率，

流感没法走通的养蛊机制，新冠病毒却利用得风生水起。

这就是新冠病毒与众不同之处。

——最后，让我们共同膜拜一下真·大佬：

所以Ravi Gupta老师想通这个道理的时间，

既不是现在，

也不是2022年1月，

还不是2021年9月或者6月，

而是不会晚于2021年1月2日……